1-2 芳香族胺基酸及其物理特性

0:11 接下來這幾個胺基酸呢~ 因為它們的化學結構裡面 都有一個苯環的構造 這種芳香族環狀的結構 所以我們稱它為 aromatic 胺基酸 芳香族的胺基酸 首先看 phenylalanine 本來 alanine 裡面的一個 H 被 phenyl, 苯環所取代，它的名稱就叫 phenylalanine 再過來呢 苯環的上面如果再加一個氫氧基(羥基)，這個胺基酸就叫 tyrosine

0:46 那氫氧基(羥基)的英文叫 hydroxyl group 最右邊這個胺基酸，你可以想像它原本的甲基 其中一個氫被底下這個官能基給取代 底下這個官能基的英文名稱叫 indole 這樣子的環狀結構(鍵)結上來，這個胺基酸叫 tryptophan 那前面我們在胺基酸分類的時候 一開始是說: 第一群胺基酸都沒有極性

1:21 芳香族的胺基酸有沒有極性呢? 我們先從左邊的 phenylalanine 來看一看 phenylalanine 的 R group 裡面 也都是碳氫飽和 所以它是沒有極性的 那 tyrosine 裡面因為多了一個氫氧基 所以它開始有一點極性 那 tryptophan 裡面呢? tryptophan 裡面 R group 這邊 有一個氮(N)元素 所以它也是有極性的

1:53 對這三個胺基酸來講 Tryptophan 裡面的氮 跟 tyrosine 裡面的氧(O) 這兩個(元素)的極性，是差不多的、差不多大小 phenylalanine 的極性非常、非常的小 所以 我們比較的時候可以說，tryptophan 跟 tyrosine 的極性是差不多，但是它們遠大於 phenylalanine 可以說 phenylalanine 是沒有極性 那這三個芳香族的胺基酸還有一個物理的特徵

2:25 因為它們的環狀結構裡面都有 雙鍵 所以它們可以吸收紫外線的光 當我們把相同濃度的胺基酸 放在光譜儀裡面 可以測到它的吸收光譜 Tryptophan的話呢，會測到 這一條藍色的光譜 如果放的(樣品)是 tyrosine 得到的結果是這一條紅色的(光譜) phenylalanine 吸收的程度非常的弱

2:57 所以幾乎都在 baseline 這邊 那它們吸收最強的波長，是在 280 nm (奈米)的位置 那不同物質它吸收光的程度 是這種物質的特性 所以如果來比較一下這三個芳香族胺基酸 吸收紫外線光的特徵的話 我們可以用 ε (epsilon) 這個符號來表示，這個代表它的莫耳吸光係數

3:28 所以，從圖上來看的話，tryptophan 吸光的程度 大於 tyrosine 遠大於 phenylalanine 這些光譜學上的特性 都遵循「比爾定律」 那我們來複習一下，什麼是「比爾定律」? 所有的吸收光譜儀的設計 大致上都相同 會有一個光源 然後通過一個 光柵或者是分光器，選擇特定的波長

4:00 然後把光打出來，通過我們的樣品 樣品會裝在「比色管」裡面 打出來的光，有一部分被樣品吸收 剩下來的光再穿過樣品 達到偵測器 假設 從光源射出來的光的強度是 Io 有一部分的光被樣品吸收 剩下的光進到偵測器的只剩 I 的強度 偵測器計算之後會給我們一個讀數，叫「吸光值」(A)

4:33 它這個「吸光值」(A) 是怎麼訂出來的呢? 吸光值是由光源所射出來的光的強度，Io 除以最後偵測器所收到的強度，I 然後取log，就得到我們的吸光值，A 那這個吸光值又剛好等於: ε 乘上 c，乘上 l ε 是每一種吸光物質的特性 我們稱為「莫耳吸光係數」